立志成为世界第一的神奇宝贝专家——小智，仍旧与皮卡丘一起继续修行之旅。小智在旅行途中遇见村正，他希望小智能与他的儿子——新吾来场神奇宝贝对战。而新吾却认为，胜败的结果只需根据电脑中的记录资料就可以明了。因此，深信记录资料的新吾，与相信神奇宝贝的小智展开了一场决斗。新吾的巨钳螳螂，无论速度及攻击力都是一等一的神奇宝贝。为了对付它，小智选择防御力超强的赫拉克罗斯来迎战。在这场激烈对战的最后阶段，小智与赫拉克罗斯这对搭档，因展现出超乎资料上的实力，最后取得胜利。小智很高兴又出现了一位强劲的对手！而他也继续朝下一个城镇，继续他的旅程！！