为了参加城都联盟赛，小智一行人继续他们的旅程。在前往桧皮镇途中的森林里，小智收服了火球鼠，并且和这个新伙伴一起来到桧皮镇。小智一到达镇上，为了完成大木博士所托付的任务，马上将GS球交给钢铁先生。接下来，为了取得第二枚徽章，小智他们继续前往桧皮练功场！！桧皮练功场首领阿笔，相当擅长使用虫系神奇宝贝。在首领对战中，第三只派出的强手是飞天螳螂，他的攻击力与防御力都是数一数二的厉害，让小智陷入空前的苦战……最后，小智还是得到第二枚徽章——昆虫徽章，并且朝下一个练功场继续他们的旅程。