立志成为世界第一的神奇宝贝训练师的少年小智，从大木博士那里得到第一个神奇宝贝皮卡丘之后，随即开始修业旅行。不过这个皮卡丘非常讨厌狭窄的地方，是一个与众不同的神奇宝贝。它的性格很害羞、怕生，刚开始小智只有被电击的份，在战斗的过程中，两人的友情才渐渐地发展起来。之后，在途中遇见小霞、小刚这两位同样立志成为最强的神奇宝贝训练师的伙伴，一同踏上冒险的旅程。陆续捉到绿毛虫、比比鸟等等神奇宝贝之后，小智一行人开始将目标定在参加神奇宝贝大赛所需要的条件——收集徽章。不过，凯觎小智皮卡丘的火箭队，却每次都来捣乱。      在华蓝市训练馆的战斗，虽然在暖昧中结束，但小智还是漂亮地得到了蓝色徽章，下一回他还会遭遇到什么神奇宝贝呢？