《温热病指南集》包括《温热病大意》、《风温证条例》、《湿温证条例》3篇。温热病大意》以《内经》“冬不藏精，春必病温”的要旨为依据，阐明温热病发病与六淫四气的关系，辨析伤寒与温热病之异，提出治疗温热病当以“辛凉”、“泄热”为基本治疗原则，此篇相当于温病总论。《风温证条例》计12条，以条文形式辨析风温证治。《湿温证条例》计31条，全面论述了湿温证的发生发展规律和辨证论治，内容以湿温、暑湿等夏秋季节的常见病为主，兼及痢疾、寒湿、下利等病证。