3月2日——学期即将结束的一天，一名神秘的美少女突然转到了星野一辉的班上。本来这少女应该与他没什么交集的，谁知她开口的第一句竟是“星野一辉，我是来摧毁你的”。这是怎么回事？不仅如此，一辉随后又被告知他们生活的这个世界正在不断地重复“3月2日”，而他的任务就是和麻理亚一起找出这场重复的根源。一番实验探索之下，他们发现这一切都是源自于一个“虚空之盒”……《虚空之盒与零之麻理亚》开卷，大家一起坠入这无止尽的虚幻中吧！