大岭醍哉突然不来学校了，没有知道他的去向。直到醍哉再次出现，一辉发现这位好友不仅得到了“盒子”，而且利用“盒子”制造出了一个需要玩家们互相残杀的生存游戏。一辉被迫卷入这个游戏当中，同时发现麻理亚和同校几位学习顶尖的学生也成了玩家。游戏开始之后，众人为了保命和成为游戏的最终赢家不得不互相猜度、陷害、残杀，唯独一辉与麻理亚不忍心对同伴下手，但是自己不杀人就只能等着被杀，面临这种生死攸关的难题，一辉与麻理亚做出的选择竟是——?!充满谜团、危险以及感动的《虚空之盒与零之麻理亚3》，崭新的阅读享受！