小男孩尼尔斯是个调皮捣蛋的家伙，老爱欺负小动物。这一次，他因为对小妖精恶作剧，被变成了一个只有拇指大的小人！小小人尼尔斯阴差阳错地骑上了家鹅马丁，跟着大雁群一起飞往遥远的北方。在这漫长而又危险的旅行里，尼尔斯不仅要保护大雁和马丁不受狐狸斯密尔的伤害，还要逃脱乌鸦强盗们的魔爪，帮助鸟类们打败灰田鼠兵团……经过这些磨难，他终于变成了一个勇敢懂事，乐于助人的好孩子。只是，最后他到底能不能打破小妖精的诅咒，变回原来的样子呢？