《史记探源》书八卷，先为序证，论说贯串全书之问题，如春秋古文、尚书古文、书序、终始五德、十二分野等事，然后分本纪、十表、八书、三十世家、七十列传一一进行考辨，除《管蔡世家》等十篇外，全部都有仔细深入之辨析。在对《史记》原文的勘误论证大都可从，唯所论刘歆窜改之事多有主观臆断之嫌。尽管如此，崔氏能以怀疑精神对《史记》全书进行深入考辨，对于中国古史的记述提出独到的分析，对于古史研究以及《史记》本身内容的认识，确有重要价值。