《文化、社会网络与集体行动:以晚清教案和义和团为中心》共选入了作者近二十多年来陆续写作的学术论文和其旧著中抽出的少量章节，共26篇文稿。这些作品的研究方向是基本一致的，仅为了阅读方便，没有按发表时间顺序编排，而是据写作所侧重的内容，大体上分成了四个编目。各编之间的界限也未必清晰。这和目前一些史家学人的学术研究所涉及的领域颇广，因而在他们的文集中编目分类也相当明确的情况，是不大一样的。第一编是侧重于史学方法的几篇习作。第二编是关于思想文化史研究对象的探索。第三编是晚清教案描析。第四编是义和团若干问题的研究。