《图解物种起源（精编美绘版）》中用大量资料证明了形形色色的生物都不是上帝创造的，而是在遗传、变异、生存斗争和自然选择中，由简单到复杂，由低等到高等，不断发展变化的，提出了“生物进化论”学说，从而摧毁了各种唯心的“神造论”和“物种不变论”。“进化论”与“细胞学说”、“能量守恒和转化定律”一起被学界誉为19世纪自然科学的三大发现。其主要著作还有《人类起源与性选择》、《人类和动物情感的表达》、《贝格尔号航行期内的动物志》、《贝格尔号航行期内的地质学》等。