《环境微生物学（新2版）》从微生物对环境的污染、微生物在环境中的指示作用以及微生物治理环境污染三个角度介绍了环境中微生物主要类群的识别、水体质量的微生物监测与评价、污水中菌落总数检测、污水中大肠菌群的检测、污水生物治理中微生物的作用、微生物降解污染物能力的测定、微生物实验室建设等常用技能。在编写过程中，适当地降低了理论知识的深度和广度。在项目任务之间链接一些相关的知识或阅读材料，尽可能拓展学生的知识视野，增加了《环境微生物学（新2版）》的可读性。此外，《环境微生物学（新2版）》还附有常见水生微生物图谱，以供师生在教学和实践过程中参考