《独秀文存》分为论文、随感录，通信三卷。其中，论文部分所收文章主要发表在《新青年》上，如《敬告青年》、《法兰西与近世文明》等，文风汪洋恣肆，论理鞭辟入里。《随感录》为针对性很强的杂感，短小精悍，多则百余字，少则数十字。这些“寸铁”（即子弹，钱玄同语）般尖锐有力的杂感直指当时的现实问题，射向军阀、政客、官僚、遗老遗少等。通信是书中*重要，*能反映陈独秀思想的部分，主要是主创《新青年》时期读者的来信，陈独秀对这些来信一一公开作答。来信者有教授、学者、文化保守主义者、青年学生、《新青年》同仁，探讨的内容主要涉及文化与思想革新。针对来信的内容，陈独秀或赞同，或驳斥，或辨析，不少回信文字不多，虽寥寥数百字，却有泰山压顶的风雷之势，迅疾就将对手“打翻在地”。诚如蔡元培先生在1933年该书第九版所做的序言里所说：“这部文存所存的都是陈君在《新青年》上发表过的文章，大抵取推翻旧习惯创造新生命的态度，而文章廉悍，足药拖沓、含糊等病；即到今日，仍没有失掉青年模范的资格。”