《日本政治思想史研究》是丸山真男的成名作和代表作，初版于1952 年。丸山在以本书为代表的一系列著作中，运用独特的思想史方法，对日本近世以来的政治思想做了开创性的阐发，奠定了战后日本的新政治学的基础，也创建了超越政治学领域的、为战后日本社会科学所共有的基本研究范式——从日本人的深层心理和精神构造入手，分析其政治乃至社会行动样式，从而寻找从人和文化的角度而非经济结构的角度来深化社会科学认识的途径。 在书中，丸山致力于寻找日本思想自身的现代性资源，从而打破日本的现代化是由西方引起、日本的现代性思想也是西方影响的产物的通说。他着重描绘了作为德川幕府统治意识形态的朱子学的解体过程，以及与此相伴的徂徕学、宣长学等富含现代转换契机的学说的发展和演变。在朱子学被视为封建腐朽思想的日本学术界，丸山这种新鲜的视角无疑为审视朱子学提供了新的可能性。此外，丸山还从满怀现实观照的视点出发，对日本早期民族主义的形成及其特点进行了论述。 如今，本书在日本知识界早已成为一个典范，是后世无论持何种论点的人都要参照的坐标，也是丸山真男以其超凡才智谱写出的“作为思想史家”的华彩乐章。