米塞斯维特庄园的主人克雷文先生在爱妻过世之后，因为悲伤过度而变得阴郁古怪、消沉遁世。克雷文先生每次见到长着和妈妈一样漂亮面容的儿子科林，都会引起极大的悲伤，于是他选择逃避，终年在外漂泊。因父母感染霍乱去世，玛丽一夜之间变成孤儿，被送往英国约克郡姑父克雷文先生的庄园生活。在庄园闲逛的时候，她找到了尘封已久的秘密花园的钥匙。在那里她结识了喜欢和动物交朋友的迪康。他们一起在秘密花园里耕种，使花园从此焕发出盎然生机，到处充满了大自然的魔力。后来玛丽结识了忧郁悲观的表兄科林，并以自己的乐观感染了科林，帮助他战胜了“心魔”，把他带进了生机盎然的秘密花园。在花园劳动、玩耍的过程中，科林变成了一个健康的、生机勃勃的男孩。zuihou，在欧洲旅行的克雷文先生也重返庄园，找到了丢失已久的快乐。科林也获得了久违的父爱。