2016版标准分为“靠前部分  临床医学专业本科毕业生应达到的基本要求”和“第二部分 临床医学专业本科医学教育标准”两部分。靠前部分涵盖“科学和学术领域”、“临床能力领域”、“健康与社会领域”和“职业素养领域”4个方面。第二部分包括“宗旨与结果”、“教育计划”、“学业成绩考核”、“学生”、“教师”、“教育资源”、“教育评价”、“科学研究”、“管理与行政”和“持续改进”10个领域。    与2008版标准相比，本版标准分为基本标准和发展标准。基本标准为医学院校必须达到的标准，用“必须”来表达。发展标准为靠前所倡导的本科临床医学教育高标准，体现了医学教育发展的方向，用“应当”来表达，达成情况因各医学院校的不同发展阶段、资源状况和教育政策不同而有所不同。2016版标准的主领域仍为10个，亚领域由原来的44个调整为40个。条目包括113条基本标准和80条发展标准。为增加可读性，新标准采用了数字索引方式，同时为便于理解和操作，注释内容增加至92条。