《瘟疫发源》系清代医家马印麟纂，是一部运用五运六气学说论述瘟疫的温病学著作，初刊于清雍正三年（1725）。全书分上下二册，不分卷。作者参照明代张景岳《类经》一书，“将瘟疫一门，由博返约”，从五运六气学说出发，论述瘟疫病之病因证治，并针对气运不同的年份提出了不同治法，创制了相应的药方，用于不同气运年的瘟疫防治，并列举病案验证说明，且通过推算，预测某年可能有瘟疫流行而早做准备。内容深入浅出，见地中肯，理论和实践相结合，自成体系，是清代以来较有实用价值的运气学、温病学著作，时至今天仍有较大的临床指导意义和实用价值。此次整理以清雍正三年初刻本为底本, 甘豫熹抄本为主校本，明天启四年天德堂刻本《类经》为他校本。