《第99只萤火虫2》讲述了开朗善良的可爱女生可可从小到大都做着同一个怪梦，梦中的她总隐约听到翅膀的拍打声，还有许多的萤火虫排着队带她去往某处。随着两位同样人气爆增的花样男登场，她的情感世界从此便不得安宁，总是陷入混乱的战场中，在越来越深入的交往中，两位花样男的奇异身世渐出水面，而可可身上的不为人知的力量呈现让这一切更让人如坠云雾里，可可心底里那个为他欢笑为他哭泣的影子终究会是谁呢？在爱与被爱，了解与被了解，伤害和被伤害种种背后，他们几个能分清楚情感的最终方向吗？