随着人类和模式生物基因组测序工作的迅速发展，有关核酸、蛋白质序列的结构与功能的数据与时呈指数俱增。基于生物技术和信息技术的融合，对这些海量生物学数据进行联手处理、分析，有助于阐明和解读基因组数据中所包含的生物学意义，从中发现重大生命科学的规律，揭示生命奥秘，这将是基因组学这门新兴的交叉学科所承担的重要任务。 掌握基因组数据分析方法是解开生命奥秘的钥匙。本手册从大规模基因组测序入手，顺沿基因组数据的产生、储存、检索和分析这条线索，依次介绍了测序分析软件（Phred-Phrap-Consed）、序列同源性联配分析工具（BLAST、SlM4、CLUSTALW）和蛋白质结构预测，以及蛋白质序列功能注释、分类和代谢途径分析等软件的功能和用法，此外，还介绍一些网络公共数据库资源和杭州华大基因研发中心研制的EST序列分析系统。初学者可“对号入座，各取所需”。 本手册既可作为从事生物学、医学、农学、计算机科学等领域的科研及教学人员的工具书，也可作为大学生和研究生的实习指导用书。本手册可以帮助读者初步掌握基因组数据分析的方法，并为他们学习基因组学导航。