终极一战后，真中剑悟孤身进入永恒核心内部，以稳定永恒核心。然而，地球只迎来了短短两年的平静，怪兽再度频繁出没，世界各地的超古代文明遗迹也接连遭到入侵。这时，一个自称超古代文明后裔的人预言，剑悟将被永恒核心同化，然后永远消失。于是，精英胜利队在新队长时冈龙一的带领下，开始了营救行动。然而，谁也想不到，这竟然是一个阴谋。邪恶特利迦出现了，精英胜利队、特利迦奥特曼、泽塔奥特曼联手展开反击。