《终极魔王》故事中失踪事件已经过去差不多两年了。在那灾难性的一刻，地球上数百万人一下消失得无影无踪，而其他东西却原封未动。航空公司飞机驾驶员雷福德·斯蒂尔当时正驾驶着一架大型喷气式客机返回芝加哥，机上载有三百名旅客与机组人员。飞机起飞时，机舱内所有座椅都坐得满满的，但顷刻间却出 现了一百多个空位。座椅上留下的只有失踪者的衣服、首饰、眼镜和鞋袜。七年灾难期已过去四分之一，在强人卡帕斯亚的领导下，世界共同体完成强制性全球裁军。为了报复美英武装的叛乱，卡帕斯亚下令对芝加哥等大城市进行大规模空袭。身为机长的雷福德虽然知道内情，但囿有在于卡帕斯亚身边，只能在电话中只言片语提示女婿巴克与女儿切丽尽快离开。世界共同体元首卡帕斯亚下令去罗马，接回首任“世界统一宗教”最高教首，在飞机上他酝酿着统一世界的更大阴谋。这时《启示录》上预言的大地震爆发了……