本教程的实验主要分为两大部分：第一部分为医学微生物学实验，包括细菌学、病毒学、真菌学的常规实验，如显微镜的使用、标本观察、染色鉴定等，还引入了多个综合性实验；第二部分为医学免疫学实验，以培养学生的基本技能为原则，囊括了免疫学中常规使用的基本技术，还增加了综合性实验和设计性实验的内容，设计性实验注重引导学生利用所学知识，对具体临床病例进行合理的判断，并利用免疫学实验加以验证，从而培养学生独立思考和灵活运用所学知识的能力。