第一部分至第六部分为医学微生物学基础理论、基本知识和基本技术原理的主要部分，系统阐述细菌学、越菌学和病毒学三大微生物学领域的微生物生命特征及其生活的一般规律、包括形态结构与分类、生理、致病性与毒力因子、致病机制、免疫性、微生物学诊断和感染防治的一般措施和技术原理；第七和第八部分阐述各种致病微生物与人类疾病的关系，重点阐述不同微生特的特殊性状及其所致疾病、各种感染及机制、临床现象与处理措施；第九部分介绍临床传染病、感染及感染相关性疾病发生的一般规律，包括局部与系统感染的机制和临床现象。