《企业内部控制配套指引讲解》按照2010年4月26日发布的《企业内部控制配套指引》的具体项数，共分为二十章，每一项指引各成一章。其中，第一至第十八章是《企业内部控制应用指引第1号--组织架构》等18项应用指引的讲解，第十九章是《企业内部控制评价指引》的讲解，第二十章是《企业内部控制审计指引》的讲解。每一章均由二部分组成。第一部分是指引的具体内容。第二部分是文字讲解部分，这一部分通过对每一项指引中核心内容的详细剖析，加深企业对各项指引的理解，使得内容更为具体、读者更易掌握。比如：在第一章《组织架构》中，重点从组织架构概述、应当关注的风险、企业组织架构的组织领导、企业组织架构的设计程序、企业组织架构的设计方法、企业组织架构的运行程序以及企业组织架构运行中的注意事项等七个方面对指引进行剖析。