《中国海关通关业务指导》对海关及通关业务进行系统梳理，涵盖海关管理与报关、报关程序和流程、对外贸易管制制度、进出境货物海关监管、通关作业规范、卫生检疫、动植物检疫、进出口食品安全、商品检验、商品归类、进出口税费、报关单填制、法律制度（统计、稽查、知识产权、行政处罚、行政复议、行政裁定等）等内容。尤其在通关作业流程、报关程序和对外贸易管制制度中将关检融合后的关键点进行了阐述。