《科学发展观百科辞典》共分为十二类：中国特色社会主义，科学发展观基本内涵，构建社会主义和谐社会，建设社会主义新农村，建设创新型国家，走和平发展道路，加强党的执政能力和先进性建设，中共十六大以来重要会议和文件，中共三代中央领导集体关于发展的重要思想，马克思主义经典作家关于发展的重要思想，外国关于经济社会发展的思想，中国传统文化关于和谐、发展的思想。