《许叔微伤寒论著三种》分为《伤寒百证歌》《伤寒发微论》《伤寒九十论》三部分，点校的底本分别为：《伤寒百证歌》底本为清光绪七年吴兴陆氏十万卷楼丛书本、清咸丰二年壬子藏修书屋刻本；《伤寒发微论》底本为清光绪七年吴兴陆氏十万卷楼丛书本；《伤寒九十论》底本为清成丰三年癸丑木活字排印琳琅秘室丛书本。三部分的主校本为1956年商务印书馆出版的《许叔微伤寒论著三种》，参校本为l993年人民卫生出版社出版的《许叔微伤寒论著三种》和2006年中国中医药出版社出版的《许叔微医学全书》。 点校的方式：原书繁体字改为简体字，通假字和异体字原则上径改，特殊情况者予以保留。竖排变横排。原书的“右”改作“上”，并根据读者阅读习惯，加以标点符号。原书中的错漏之处径改之。需要告知读者的是，许叔微原著中所引用的《伤寒论》《金匮要略》等原文，因其采用的版本不同，与现行通用的赵开美版有个别文字的差异，我们尊重许叔微所引用的原文以及许叔微所作所写，除非明显错字之处，一般不做改动。