六年级学生不二夫君发现院子树林里有一黄金怪人，可以瞬间变成少年和只有二十厘米高度的矮个。不久，其父亲珍藏的《库丁贝尔克圣经》失窃。又不久，少年侦探团长小林君被诱骗落入魔掌。黄金怪人又布迷魂阵，企图诱骗明智大侦探。明智将计就计，救出少年侦探小林君等，与少年侦探团一起协助警方捣毁了魔窟。最终，撕下黄金怪人的假面具，价值连城的《库丁贝尔克圣经》也完壁归赵。