远在灾难总部建立、林间空地建成、托马斯进入迷宫之前，地球就遭到了太阳耀斑的袭击，疾病肆虐，吞噬着人类。生活在纽约的少年马克目睹成千上万的生命被太阳耀斑夺去，紧接着又遭遇了洪水、食物短缺和令人窒息的滚滚热浪。马克和女友翠娜在退役军人亚历克的帮助下，带领一群幸存者辗转迁徙到远离海洋的阿巴拉契亚山脉地带。但是好景不长，一艘神秘飞船带来致命病毒在人群中急剧扩散、肆意传播。马克一行跋山涉水，冒着生命危险寻求飞船的来由和疾病产生的原因。他们遇见一个名叫迪迪的小女孩，奇怪的是迪迪在被带有病毒的飞镖射中后却没有感染。马克他们决定保护迪迪，把她送到一个安全的地方，希望有人能够借此研究出针对病毒的解药，他们能成功吗？