《日本侵华战争遗留问题》在广泛吸收各国学者研究成果，尤其是汇总本课题组成员多年来的有关研究成果的基础上，通过对历史与现实的考察，专题与综合的论证，对日本侵华战争遗留问题及其对中日关系的影响，作出总体评析。《日本侵华战争遗留问题》构筑了对于日本侵华战争遗留问题的学术研究的基本框架。首先从日本侵华战争造成的中国军民伤亡及经济损失的统计入手，追究日本天皇、军部和政府的侵华战争责任；随后以分析日本侵华战争责任未予清算的原因为背景，综述日本侵华战争遗留问题的内涵；接着探讨日本侵华战争遗留问题的根源——历史认识问题的触发和演变，评述战争受害者对日索赔诉讼的现状；最后解析日本侵华战争遗留问题的症结及其对中日关系的影响；在结语部分，提出解决日本侵华战争遗留问题，寻找“化干戈为玉帛”的途径及标准。