小小名侦探江户川柯南，其实是被迫喝下神秘组织的毒药而变成小孩的高中生侦探——工藤新一。他的父亲是世界知名的推理小说家，母亲则曾为女演员，两人都住在海外，所以新一只好隐藏真实的身份，暂住在女友毛利兰家中。小兰的父亲毛利小五郎原本是个呆头呆脑的侦探，但现在靠着柯南的帮忙，倒也成了家喻户晓的名侦探。另一方面，有关西高中生名侦探之称的大阪府警署本部长之子—部平次，则是知道柯南秘密的竞争对手。某日，平次与女友和叶为了参加结婚典礼而来到东京。柯南他们在陪同游览的途中也被招待到即将举行结婚典礼的森园家，没想到竟然发生了杀人事件……