《卫生部“十二五”规划教材·全国高等医药教材建设研究会“十二五”规划教材：医学微生物学（第8版）》沿用了上一版的基本框架，以绪论、细菌学篇、病毒学篇、真菌学篇及附录的顺序进行编排。兼顾知识的基础性与先进性，在深度和难度的总体把握上略高于第7版教材整体水平。重要概念、原理及重点内容仍以黑体字加粗显示，非基础知识及研究进展等拓展知识还以小字编排。