《清宫那些事儿》共分七部分，分别为：“清十二帝系列”，管窥清代帝王的奇闻趣事；“清宫后妃系列”，详解清宫后妃的爱恨情仇，风花雪夜；“清宫‘政事儿’系列”，透视帝王临政过程中的秘闻细节；“清宫秘档系列”，揭开宫闱秘闻的神秘面纱；“清宫‘闲事儿’系列”，还原走下神坛的帝王志趣；“王公大臣系列”，讲述清代重臣与帝王关系；“清陵‘鬼吹灯’系列”，细数清代皇陵的是是非非。作者注重从宫闱秘闻的角度，破解那些隐藏在档案中的神秘故事。同时又体现时代特色，对时下人们关心的话题，在《清宫那些事儿》中有不同程度的反应。比如“保健系列”“美食系列”“穿戴系列”“囧事系列”“珍宝系列”等，从中可以破解很多历史之谜。