魔法画家铅笔头和巧手大师小铁皮开办了一所魔法学校。在这所学校里，铅笔头和小铁皮有三个学生：小树枝、小黄雀和小娜斯佳。后来又出现了第四个学生——邋遢的小家伙巴布奇，因为这个孩子，铅笔头和小铁皮相继离开了学校。在此期间，两个坏蛋——海盗布里布里和间谍德尔卡——趁虚而入，把魔法学校变成了海盗学校。在魔法学校里，铅笔头和小铁皮教给孩子们什么样的知识呢？他们为什么要离开魔法学校？被坏蛋们占领以后，魔法学校变成什么样了呢？最后到底是谁拯救了铅笔头、小铁皮和魔法学校呢？