《明清破局》以乾隆四十一年开始编纂的《贰臣传》为主要研究对象，重点谈论明清之际知识分子的人生选择与历史作为：作者从1644年这个“天有三日”的特殊时期引入，借助大量明清史古籍资料，重返明清之际的现场与背后，在小心考证的基础上，对一些争议的历史进行了澄清与纠正，而对尚未有明确结论的迷案，则揆诸人情，合理推测，力求最大可能还原明清之际明臣降清的前因后果，其中既有范文程、洪承畴这样的开国之良辅，也有孙定远、孔有德等对“二主”清朝忠诚殉国者，也有谢陞、钱谦益等在新朝任职却“无建树者”。