随着社会经济发展与交通运输业发展的阶段性转变，在国家重大政策与战略、个人与家庭出行、企业运输物流以至供应链管理等方面，都对运输经济学科提出了诸多现实研究需要。与此同时，运输经济学发展本身也面临着诸多理论问题的困扰与挑战，必须关注那些由学科基础性内核所决定的基本科学问题并给予解释。运输经济学正在经历一个阶段性的重要转变，必须完成自身基础理论框架的构建。一个学科成熟程度的标志包括：具有相对独特的研究对象或视角、形成相对独特的研究方法、发掘出相对独特的基本科学问题，并在经济生活中发挥非其他学科所能替代的作用。运输经济学是应用经济学的一个重要分支，与其他行业相比，运输业更具网络经济、自然垄断和公益性等特征，这使其在供求关系、投资建设、运营组织以及政府作用等方面的重要性和复杂性更加明显，运输活动对社会经济的深层影响，也需要更有针对性的经济学分析和解释。