为适应计算机科技迅猛发展的形势，满足广大读者及时获得计算机科技领域更新知识的需求，《计算机科学技术百科全书》第二版在第一版的基础上进行了增、删与改写，并对第一版的框架作了适当调整。《全书》第二版在原有的“计算机科学理论”、“计算机组织与体系结构”（第二版改名“计算机组成与体系结构”）、“计算机软件”、“计算机硬件”、“计算机应用技术”和“人工智能” 6 大分支基础上增加了“计算机网络”分支；在各个分支中除了适当增加新条目外，还对第一版框架中一些过于细小条目进行了合并、改写与删节，对一些已现陈旧的条目则予删除。第二版对“计算机科学技术总论”也做了一些修改与补充。《全书》第二版共收录条目1381条，比第一版略有增加。其中，“计算机科学理论” 172 条、“计算机组成与体系结构” 133 条、“计算机软件” 320 条、“计算机硬件” 162 条、“计算机网络” 245条、“计算机应用技术”244 条、“人工智能”105 条。力求对每个条目赋予简明而确切的定义以及较为明确而完整的内涵，取材于肯定成熟的知识，言必有据，确切可信。