根据与花袋一起出现的夏目带来的情报，侦探社与Mafia得知了陀思妥耶夫斯基的据点就在横滨的一处废弃煤窑里。在太宰的指示下，敦与芥川合作执行潜入计划。二人虽然不和，但是为解救各自的首领，最终还是成功逼出病毒异能者普希金，解除了施加在首领们身上的病毒，太宰与异能特务科也合力抓住了陀思妥耶夫斯基。然而事情还远未结束。“完美犯罪者”小栗虫太郎使用着能够消除犯罪证据的异能力“完美犯罪”，使追查陀思妥耶夫斯基的乱步陷入前所未有的苦战之中。同时，太宰被逮捕、“天人五衰”的阴谋、神秘异能者“果戈里”设计陷害武装侦探社……各种事件接踵而至，侦探社陷入了前所未有的危机之中！