《海公案》虽为记叙海瑞折狱故事，但并非海瑞断狱之实录。全书所记71个案件，经与天启梁氏刻十二卷本《海忠介公集》所收录的许多案卷相对照，竟没有一个案件相同，显系小说家的杜撰和虚构。《海公案》卷首载有《皇明都御史忠介公海刚峰传》一文，所记多与史实不符，如以海瑞的母亲谢氏为杨氏，将海瑞的侍妾丘氏说成是夫人，说海瑞曾任浙江台州府教谕，把海瑞于万历十二年再度出山说成是万历七年等等，有很多讹错。所以此书如果作为研究海瑞居官政绩的史料来看，是无可征信的。