《药性分类主治》分（药性主治）（分类主治）两篇。（药性主治）在编排体例上结合临床，按照药物的主治症聚类，仿通用药之例，以病为纲，以病类药。这种编排方式，有利临证选药。（分类主治）以药物功效类列药物，以功效阐释药物的具体应用，以药物的（直接功效）为中心，比较药物的药效机理等，对现代临床中药学（功效）专项的确立、发展和完善产生了一定影响。本次整理以清同治二年癸亥（1863）育德堂刻本为底本。