《日本侵华殖民教育史料(第三卷)》所选资料以中国第二历史档案馆所藏档案及公报、年鉴等原始文献为主，适当地选录由上海市档案馆、浙江省档案馆、广东省档案馆、福建省档案馆等编辑出版的相关史料汇编中的部分史料，并收录了少量当时的报刊资料。中国第二历史档案馆是国内集中典藏民国时期中央政府档案的档案馆，收藏有1912―1949年各个历史时期档案近230万卷，其中涉及日伪统治时期教育的档案资料就达数万卷之多。《日本侵华殖民教育史料(第三卷)》所辑资料大多选自中国第二历史档案馆馆藏的伪维新政府行政院和教育部、汪伪国民政府、汪伪行政院、汪伪教育部、汪伪宣传部、国民政府教育部等全宗的档案，其中不少档案资料属首次正式公布，弥足珍贵。