绫辻行人被世人称为“杀人侦探”，因为他拥有的异能力是只要看穿杀人案的真相，凶手就必定会死于非命。负责管理危险异能者的异能特务科派了一个新来的特工——辻村深月去监视他，可辻村却总是被机智过人又言辞刻薄的绫辻捉弄。某天，绫辻与辻村接到了政府的委托，内容是解开一宗离奇杀人案的谜题。然而他们没有想到的是，这居然是他们与绫辻的宿敌，也是全社会公敌的妖术师京极夏彦之间展开殊死搏斗的开端——