《普通高等教育十一五国家级规划教材·全国高等中医药院校规划教材·中医基础理论》的编写指导思想是：贯彻“以人为本”的教育思想，坚持继承与创新相结合的编写思路。按照普通高等教育全日制五年本科《中医基础理论课程教学大纲》和要求。在充分吸收以往几版教材所优点的同时，适度增加了一些新的教学内容和研究和成果，以反映中医学现代化的要求。《普通高等教育十一五国家级规划教材·全国高等中医药院校规划教材·中医基础理论》的编写以保持中医学的传统特色为宗旨，注重中医基础理论的完整性、系统性、科学性、在对中医学的基本理论充分阐释的同时，适度指出它们的临床指导意义，做到理论与实践相结合。