《孟庆云讲中医基础理论》为作者在北京市中医管理局委托中国中医科学院研究生院、举办的北京市首届西学中不错研究班讲授《中医基础理论》课程的录音整理稿。分上下两篇：上篇为总论，阐述了中医学的医学观和方法论；下篇各论包括阴阳、五行、藏象、经络、精气神血津液、病因病机、诊法治则、五运六气、养生等。 《孟庆云讲中医基础理论》内容不同于高等中医药院校开设的《中医基础理论》课程，充满了作者的独特见解，以及在中医基础理论研究上的重要成果。