承接《安德的游戏：傀儡的影子》，《巨人的影子》仍将故事背景设定在未来——安德?维京率领战队赢得对外星怪物虫族的战争后留在了太空，而战斗学校的其他孩子则纷纷回到地球。其中，韩楚、阿莱、罗勒密等凭借各自的技能成为中坚力量，他们彼此牵制，罗勒密甚至不惜发动战争以夺取霸权；而安德的哥哥彼得?维京则致力于恢复地球团结，安德战队中优秀的成员豆子和佩特拉成为他的左膀右臂。最终，三人成功打破了那些邪恶的野心家的企图，平息了战争。豆子和佩特拉相爱却不能相守，孩子成为两人共同的牵绊；彼得的爱与包容赢得了佩特拉的心，在豆子不得不远走太空后，两人相伴到老……