《面向国家自主创新的高新区转型发展研究》以区域创新、集群演化、自组织等理论为支撑，在阐释高新区转型发展与国家自主创新耦合关系基础上，寻找高新区转型发展的理论渊源；根据高新区演化的阶段划分与动力机制，提出我国高新区发展中的主要路径偏差；运用战略生态位管理理论构建由企业-产业-环境嵌套式目标细分架构；基于二象对偶论剖析高新区转型发展基础，并对我国56个高新区进行实证测算与聚类分析；结合箭靶模型与聚类组合值特征，设计了我国高新区转型发展的差异化路径，并提出了确保转型发展路径实现的内构保障体系与外建服务体系。