T国玛莱市在地铁施工时，意外发现了一个神秘的巨蛋。正在当地旅游的校园三剑客的小伙伴们在古生物专家林丹博士的帮助下，到达了施工现场，但巨蛋却被T国军方带走了。为了解开巨蛋之谜，杨歌、白雪与张小开潜入了军事基地，发现巨蛋竟然孵化出了一只远古巨鸟——大鹏，为了不让T国利用大鹏的巨大能量，校园三剑客和大鹏一起，开始了一场逃离军方追捕的惊险之旅，最终他们不仅挫败了T国的阴谋，还成功化解了恐怖分子精心策划的一起袭击事件，让大鹏回到了自己遥远的星际国度。