《生物数学思想研究》作为一部论述生物数学思想的专著，尝试将生物数学思想从其内部打通，以生物数学思想的起源与形成为主线，通过透析生物数学思想演变的内在逻辑，窥觅到它的产生和发展是环环相扣的有机的统一体。《生物数学思想研究》首先对生物数学的思想体系进行整体梳理。然后把握生物数学思想产生和发展过程中各个阶段的关键点；选择具有代表性的种群动态数学模型的产生和发展过程作为突破口，并详细介绍这类生物数学模型在产生和发展过程中所经历的15种形态；详尽分析生物数学四大分支的起源与形成过程；选择生物数学思想演变过程中的5位代表人物进行个案分析；细致探析生物数学的社会化过程；给出生物数学思想未来发展方向的三点展望。很后，叙述中国生物数学的开拓过程。