以文明为单位来书写人类历史，可能是描述复杂多变的人类社会所采用的最好的统摄与说明方法。然而这却一直是个学术难题。《良渚文化与中国文明的起源》在史前、原史和历史的框架中追溯中国文明的起源，在超越文明要素论的基础上论证良渚文化在中国原史时期特殊的文明构建作用。尤其是运用当代遗传基因理论、古物候学进行开创性研究。主要论题包括良渚文化的生态地缘、良渚文化生业与复合经济、良渚文化聚落与中国最初的复杂社会、良渚文化的民族学特征、良渚文化的心灵镜像、良渚文化在龙山时代的构建性、文化进化论意义上的良渚文化、后现代考古与良渚学等。