十二岁的少女明染拥有操控时间的能力，是罕有的异能人类——时契者。  一天放学后，她感知到巨大的时间波动出现在她所在的城市。源源不断的河水正从施工的地基大坑中喷涌而出。一座龙神庙若隐若现，出现在河水深处。  一尾金色鲤鱼从水中跃出，明染眼前出现了水波化成的信囊，竟是跨越时空，从北宋明道二年传递出的消息。与此同时，好朋友鸣幽在调查龙神庙时意外失踪，明染收到了鸣幽提前准备好的北宋户籍证明。  寻着迷宫般的时间山谷，明染通过异能来到了北宋东京城。而这里也存在着时契者的对手——宇宙公敌黑暗星尘的气息。