《章太炎晚年学术思想研究》主要从章太炎晚年关于诸子学、史学、经学三个方面入手，通过他本人与时代的互动，比如在史学方面与当时影响极大的古史辨派、在经学方面与1930年代社会上的读经思潮、在诸子学方面与民国时期各类诸子学论争，将章氏言论置于当时的学术大环境之中来展开论述，《章太炎晚年学术思想研究》以此展现章氏晚年的学术形象，并且呈现出中国近代学术史之更为多元的面向。